Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms