Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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