Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms