Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms