Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms