Protein–RNA interactions for Protein: Q30KN3

Defb33, Beta-defensin 33, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb33Q30KN3 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Defb33Q30KN3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Defb33Q30KN3 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Defb33Q30KN3 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Defb33Q30KN3 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Defb33Q30KN3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Defb33Q30KN3 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Defb33Q30KN3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defb33Q30KN3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defb33Q30KN3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defb33Q30KN3 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defb33Q30KN3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defb33Q30KN3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defb33Q30KN3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defb33Q30KN3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defb33Q30KN3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defb33Q30KN3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defb33Q30KN3 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defb33Q30KN3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defb33Q30KN3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defb33Q30KN3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Defb33Q30KN3 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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