Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Rpusd2Q149F1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Rpusd2Q149F1 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Rpusd2Q149F1 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Rpusd2Q149F1 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Rpusd2Q149F1 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Rpusd2Q149F1 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Rpusd2Q149F1 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Rpusd2Q149F1 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms