Protein–RNA interactions for Protein: Q149C3

Lingo4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain containing-NOGO receptor-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo4Q149C3 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Lingo4Q149C3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Lingo4Q149C3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Lingo4Q149C3 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Lingo4Q149C3 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Lingo4Q149C3 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Lingo4Q149C3 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Lingo4Q149C3 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Lingo4Q149C3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Lingo4Q149C3 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
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Lingo4Q149C3 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lingo4Q149C3 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms