Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.3 ms