Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ttc39dQ0VF76 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ttc39dQ0VF76 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms