Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms