Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Fgf6-201ENSMUST00000000187 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cib3Q0P523 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms