Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms