Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Ttc21bQ0HA38 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Ttc21bQ0HA38 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Ttc21bQ0HA38 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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