Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms