Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms