Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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