Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NrepQ07475 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Syne1-201ENSMUST00000041639 6990 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Tns1-201ENSMUST00000169786 9966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NrepQ07475 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Synpo2-203ENSMUST00000106427 6937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms