Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms