Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms