Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Tac1-203ENSMUST00000184986 691 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm18160-201ENSMUST00000214279 827 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 AC166256.1-201ENSMUST00000219081 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 AC122301.3-201ENSMUST00000217707 716 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Stap1-201ENSMUST00000031171 909 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Lsmem1-202ENSMUST00000220951 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 D530037P16Rik-201ENSMUST00000199255 1027 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Rps25-201ENSMUST00000080300 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms