Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms