Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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