Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GscQ02591 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GscQ02591 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GscQ02591 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
GscQ02591 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GscQ02591 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GscQ02591 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GscQ02591 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GscQ02591 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GscQ02591 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GscQ02591 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GscQ02591 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GscQ02591 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GscQ02591 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GscQ02591 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GscQ02591 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GscQ02591 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GscQ02591 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GscQ02591 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GscQ02591 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GscQ02591 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GscQ02591 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GscQ02591 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GscQ02591 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GscQ02591 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GscQ02591 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GscQ02591 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
GscQ02591 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GscQ02591 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GscQ02591 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GscQ02591 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
GscQ02591 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GscQ02591 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
GscQ02591 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GscQ02591 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GscQ02591 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GscQ02591 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GscQ02591 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GscQ02591 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GscQ02591 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GscQ02591 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GscQ02591 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GscQ02591 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GscQ02591 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GscQ02591 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GscQ02591 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GscQ02591 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
GscQ02591 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GscQ02591 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GscQ02591 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GscQ02591 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GscQ02591 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms