Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms