Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms