Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Ccl21cP86793 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Ccl21cP86793 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Ccl21cP86793 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Ccl21cP86793 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Ccl21cP86793 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Ccl21cP86793 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ccl21cP86793 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ccl21cP86793 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ccl21cP86793 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ccl21cP86793 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ccl21cP86793 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ccl21cP86793 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ccl21cP86793 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ccl21cP86793 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ccl21cP86793 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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