Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprvP70289 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprvP70289 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprvP70289 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms