Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arf6P62331 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arf6P62331 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arf6P62331 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Arf6P62331 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Arf6P62331 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Arf6P62331 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Arf6P62331 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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Arf6P62331 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Arf6P62331 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Arf6P62331 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Arf6P62331 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Arf6P62331 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Arf6P62331 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Arf6P62331 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Arf6P62331 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Arf6P62331 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms