Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SnrpfP62307 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SnrpfP62307 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SnrpfP62307 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SnrpfP62307 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SnrpfP62307 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SnrpfP62307 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SnrpfP62307 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SnrpfP62307 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SnrpfP62307 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SnrpfP62307 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SnrpfP62307 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SnrpfP62307 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SnrpfP62307 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SnrpfP62307 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SnrpfP62307 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SnrpfP62307 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SnrpfP62307 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SnrpfP62307 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SnrpfP62307 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SnrpfP62307 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpfP62307 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms