Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms