Protein–RNA interactions for Protein: P61588

Rnd3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnd3P61588 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnd3P61588 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms