Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ctdsp1P58466 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.3 ms