Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms