Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms