Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rfx1P48377 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rfx1P48377 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rfx1P48377 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rfx1P48377 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rfx1P48377 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rfx1P48377 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rfx1P48377 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Rfx1P48377 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx1P48377 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx1P48377 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx1P48377 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx1P48377 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx1P48377 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx1P48377 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rfx1P48377 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx1P48377 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx1P48377 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rfx1P48377 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rfx1P48377 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx1P48377 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx1P48377 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx1P48377 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx1P48377 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx1P48377 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rfx1P48377 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx1P48377 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx1P48377 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx1P48377 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx1P48377 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx1P48377 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx1P48377 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx1P48377 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx1P48377 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx1P48377 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx1P48377 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx1P48377 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx1P48377 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx1P48377 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx1P48377 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx1P48377 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx1P48377 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx1P48377 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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