Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gbx2P48031 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms