Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VhlP40338 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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