Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TpoP35419 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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TpoP35419 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TpoP35419 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TpoP35419 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TpoP35419 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TpoP35419 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TpoP35419 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TpoP35419 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TpoP35419 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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TpoP35419 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TpoP35419 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TpoP35419 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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TpoP35419 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TpoP35419 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TpoP35419 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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TpoP35419 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TpoP35419 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TpoP35419 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TpoP35419 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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TpoP35419 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TpoP35419 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TpoP35419 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TpoP35419 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
TpoP35419 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
TpoP35419 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TpoP35419 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TpoP35419 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TpoP35419 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TpoP35419 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TpoP35419 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TpoP35419 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TpoP35419 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TpoP35419 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TpoP35419 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TpoP35419 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TpoP35419 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TpoP35419 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TpoP35419 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms