Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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