Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms