Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms