Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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