Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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