Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

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Length 770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Pou2f1P25425 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms