Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkchP23298 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkchP23298 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms