Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PparaP23204 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PparaP23204 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PparaP23204 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PparaP23204 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PparaP23204 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PparaP23204 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PparaP23204 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PparaP23204 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PparaP23204 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PparaP23204 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PparaP23204 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PparaP23204 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PparaP23204 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PparaP23204 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PparaP23204 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PparaP23204 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PparaP23204 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PparaP23204 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PparaP23204 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PparaP23204 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PparaP23204 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PparaP23204 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PparaP23204 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PparaP23204 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PparaP23204 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PparaP23204 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PparaP23204 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PparaP23204 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PparaP23204 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PparaP23204 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PparaP23204 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PparaP23204 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PparaP23204 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PparaP23204 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PparaP23204 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PparaP23204 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PparaP23204 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PparaP23204 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PparaP23204 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PparaP23204 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PparaP23204 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PparaP23204 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PparaP23204 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PparaP23204 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PparaP23204 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PparaP23204 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PparaP23204 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PparaP23204 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PparaP23204 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PparaP23204 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PparaP23204 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PparaP23204 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PparaP23204 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
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