Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Fcer1aP20489 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Fcer1aP20489 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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