Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18524 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18524 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18524 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P18524 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18524 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18524 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18524 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18524 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18524 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18524 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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P18524 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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P18524 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18524 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18524 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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P18524 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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P18524 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18524 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18524 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18524 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18524 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18524 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18524 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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P18524 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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P18524 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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P18524 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18524 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18524 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18524 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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P18524 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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P18524 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18524 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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P18524 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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P18524 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18524 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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P18524 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18524 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18524 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18524 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18524 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18524 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18524 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18524 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18524 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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P18524 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18524 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18524 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18524 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18524 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18524 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18524 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18524 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18524 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18524 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18524 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18524 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18524 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18524 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18524 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18524 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18524 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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