Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Spi1P17433 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Spi1P17433 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms